Warning: Can't synchronize with repository "(default)" (/home/git/ome.git does not appear to be a Git repository.). Look in the Trac log for more information.

Ticket #13237: 01_R3D.dv.log

File 01_R3D.dv.log, 18.2 KB (added by rkferguson, 8 years ago)
Line 
1#
2#Tag 0x00FF0408
3
4Resolve3D softWoRx-Acquire Version: 5.5.1 Release 3
5
6Running on host: iridium.openmicroscopy.org.uk
7
8Resolve3D Image File: /data1/2016-05-19_E15039_B56gamma_laser_stripe/01_R3D.dv
9
10Created  Thu May 19 13:57:23 2016
11
12
13Optics:
14  Objective:    Olympus 100X/1.40, Plan Apo, IX70
15  Lens ID:      10002
16  Aux Magn:     1.00
17
18Image Properties:
19  XY Dimensions:                512 x 512
20  ZWT Dimensions (expected):    1 x 1 x 35
21  Pixel Size:                   0.16000 0.16000 0.200
22  Binning:                      1x1
23  Flat-field Calibration:       Off
24
25Camera:
26  Type:         CoolSNAP_HQ / ICX285         
27  Gain:         1.00X
28  Speed:        10000KHz
29  Temp Setting: -30.0C
30
31
32Resolve3D Macro:
33--------------------------------------------------------
34# Created by DeltaVision PhotoKinetics Designer (Resolve3DPK)
35
36# Open the image file
37OPF
38
39# PhotoKinetics Scan request
40SCANPK 0.100000,1,0,3,1,2,0,0,1,-1.000,0.100000,1,3,5,3,32,1.000,120.000,4,1,0.500,1,0.000
41
42# Close the Image file
43CLF
44BEEP
45#
46#
47#KEY PK Experiment Designer Keys: Don't Modify
48#
49#KEY EXPERIMENT_TYPE PK
50#KEY LASER_CHANNEL 406
51#KEY DURATION 0.100000
52#KEY EVENT_REPEATS 5
53#KEY EVENT_TIME_MARK END
54#KEY EVENT_MOTION_OPTIMIZE POSITION
55#KEY EVENT_BLEACH PATTERN
56#KEY CHANNEL 0.1000,FITC,FITC,100%
57#KEY EX_SHUTTERS 3,EX=T,TRANS=F,LASER=F
58#KEY EM_SHUTTERS 1,CCD1=F
59#KEY TIME_COURSE_STYLE AUTO
60#KEY PRE_EVENT_IMAGES 3
61#KEY POST_EVENT_IMAGES 32
62#KEY PRE_IMAGE_TIME_INTERVAL 0.500
63#KEY EXPECTED_HALFTIME 1.000
64#KEY ENTIRE_EXP_REPEATS 1
65#KEY EXP_REPEATS_TIMELAPSE 10.000
66#
67#
68--------------------------------------------------------
69
70Experiment Record:
71------------------
72QLM Bleach Event Points:
73  SPOT 45.62 45.39
74  SPOT 43.55 42.95
75  SPOT 41.49 40.50
76  SPOT 39.43 38.06
77  SPOT 47.36 47.52
78
79
80Thu May 19 13:57:23 2016
81
82Image 1.
83           Time:       Thu May 19 13:57:24 2016
84           Time Point: 0.000 secs
85           Intensity:  Min = 121, Max = 1906, Mean = 411.50284
86           Photosensor reading: 2104807.0
87           Exposure time: 0.100000 secs
88           EX filter:  FITC
89           EM filter:  FITC
90           ND filter:  100%
91           Polychroic: Quad
92           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
93
94Image 2.
95           Time:       Thu May 19 13:57:25 2016
96           Time Point: 0.703 secs
97           Intensity:  Min = 118, Max = 1894, Mean = 405.67233
98           Photosensor reading: 2104807.0
99           Exposure time: 0.100000 secs
100           EX filter:  FITC
101           EM filter:  FITC
102           ND filter:  100%
103           Polychroic: Quad
104           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
105
106Image 3.
107           Time:       Thu May 19 13:57:26 2016
108           Time Point: 1.407 secs
109           Intensity:  Min = 117, Max = 1882, Mean = 401.72778
110           Photosensor reading: 2104807.0
111           Exposure time: 0.100000 secs
112           EX filter:  FITC
113           EM filter:  FITC
114           ND filter:  100%
115           Polychroic: Quad
116           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
117
118Image 4.
119           Time:       Thu May 19 13:57:42 2016
120           Time Point: 18.062 secs
121           Intensity:  Min = 120, Max = 1816, Mean = 398.18280
122           Photosensor reading: 2104807.0
123           Exposure time: 0.100000 secs
124           EX filter:  FITC
125           EM filter:  FITC
126           ND filter:  100%
127           Polychroic: Quad
128           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
129
130Image 5.
131           Time:       Thu May 19 13:57:42 2016
132           Time Point: 18.265 secs
133           Intensity:  Min = 116, Max = 1797, Mean = 393.22882
134           Photosensor reading: 2104807.0
135           Exposure time: 0.100000 secs
136           EX filter:  FITC
137           EM filter:  FITC
138           ND filter:  100%
139           Polychroic: Quad
140           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
141
142Image 6.
143           Time:       Thu May 19 13:57:43 2016
144           Time Point: 18.467 secs
145           Intensity:  Min = 117, Max = 1790, Mean = 389.58344
146           Photosensor reading: 2104807.0
147           Exposure time: 0.100000 secs
148           EX filter:  FITC
149           EM filter:  FITC
150           ND filter:  100%
151           Polychroic: Quad
152           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
153
154Image 7.
155           Time:       Thu May 19 13:57:43 2016
156           Time Point: 18.670 secs
157           Intensity:  Min = 116, Max = 1780, Mean = 386.49530
158           Photosensor reading: 2104807.0
159           Exposure time: 0.100000 secs
160           EX filter:  FITC
161           EM filter:  FITC
162           ND filter:  100%
163           Polychroic: Quad
164           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
165
166Image 8.
167           Time:       Thu May 19 13:57:43 2016
168           Time Point: 18.872 secs
169           Intensity:  Min = 117, Max = 1749, Mean = 383.70346
170           Photosensor reading: 2104807.0
171           Exposure time: 0.100000 secs
172           EX filter:  FITC
173           EM filter:  FITC
174           ND filter:  100%
175           Polychroic: Quad
176           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
177
178Image 9.
179           Time:       Thu May 19 13:57:43 2016
180           Time Point: 19.074 secs
181           Intensity:  Min = 116, Max = 1741, Mean = 381.14368
182           Photosensor reading: 2104807.0
183           Exposure time: 0.100000 secs
184           EX filter:  FITC
185           EM filter:  FITC
186           ND filter:  100%
187           Polychroic: Quad
188           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
189
190Image 10.
191           Time:       Thu May 19 13:57:43 2016
192           Time Point: 19.276 secs
193           Intensity:  Min = 115, Max = 1737, Mean = 378.77222
194           Photosensor reading: 2104807.0
195           Exposure time: 0.100000 secs
196           EX filter:  FITC
197           EM filter:  FITC
198           ND filter:  100%
199           Polychroic: Quad
200           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
201
202Image 11.
203           Time:       Thu May 19 13:57:44 2016
204           Time Point: 19.610 secs
205           Intensity:  Min = 117, Max = 1719, Mean = 376.73038
206           Photosensor reading: 2104807.0
207           Exposure time: 0.100000 secs
208           EX filter:  FITC
209           EM filter:  FITC
210           ND filter:  100%
211           Polychroic: Quad
212           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
213
214Image 12.
215           Time:       Thu May 19 13:57:44 2016
216           Time Point: 19.944 secs
217           Intensity:  Min = 115, Max = 1727, Mean = 374.63022
218           Photosensor reading: 2104807.0
219           Exposure time: 0.100000 secs
220           EX filter:  FITC
221           EM filter:  FITC
222           ND filter:  100%
223           Polychroic: Quad
224           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
225
226Image 13.
227           Time:       Thu May 19 13:57:44 2016
228           Time Point: 20.278 secs
229           Intensity:  Min = 115, Max = 1705, Mean = 372.37097
230           Photosensor reading: 2104807.0
231           Exposure time: 0.100000 secs
232           EX filter:  FITC
233           EM filter:  FITC
234           ND filter:  100%
235           Polychroic: Quad
236           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
237
238Image 14.
239           Time:       Thu May 19 13:57:45 2016
240           Time Point: 20.613 secs
241           Intensity:  Min = 113, Max = 1700, Mean = 370.10120
242           Photosensor reading: 2104807.0
243           Exposure time: 0.100000 secs
244           EX filter:  FITC
245           EM filter:  FITC
246           ND filter:  100%
247           Polychroic: Quad
248           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
249
250Image 15.
251           Time:       Thu May 19 13:57:45 2016
252           Time Point: 20.948 secs
253           Intensity:  Min = 116, Max = 1701, Mean = 367.96295
254           Photosensor reading: 2104807.0
255           Exposure time: 0.100000 secs
256           EX filter:  FITC
257           EM filter:  FITC
258           ND filter:  100%
259           Polychroic: Quad
260           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
261
262Image 16.
263           Time:       Thu May 19 13:57:45 2016
264           Time Point: 21.283 secs
265           Intensity:  Min = 114, Max = 1653, Mean = 365.79965
266           Photosensor reading: 2104807.0
267           Exposure time: 0.100000 secs
268           EX filter:  FITC
269           EM filter:  FITC
270           ND filter:  100%
271           Polychroic: Quad
272           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
273
274Image 17.
275           Time:       Thu May 19 13:57:46 2016
276           Time Point: 22.118 secs
277           Intensity:  Min = 115, Max = 1661, Mean = 364.21729
278           Photosensor reading: 2104807.0
279           Exposure time: 0.100000 secs
280           EX filter:  FITC
281           EM filter:  FITC
282           ND filter:  100%
283           Polychroic: Quad
284           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
285
286Image 18.
287           Time:       Thu May 19 13:57:47 2016
288           Time Point: 22.953 secs
289           Intensity:  Min = 111, Max = 1653, Mean = 362.36862
290           Photosensor reading: 2104807.0
291           Exposure time: 0.100000 secs
292           EX filter:  FITC
293           EM filter:  FITC
294           ND filter:  100%
295           Polychroic: Quad
296           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
297
298Image 19.
299           Time:       Thu May 19 13:57:48 2016
300           Time Point: 23.788 secs
301           Intensity:  Min = 114, Max = 1628, Mean = 360.40051
302           Photosensor reading: 2104807.0
303           Exposure time: 0.100000 secs
304           EX filter:  FITC
305           EM filter:  FITC
306           ND filter:  100%
307           Polychroic: Quad
308           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
309
310Image 20.
311           Time:       Thu May 19 13:57:49 2016
312           Time Point: 24.622 secs
313           Intensity:  Min = 114, Max = 1619, Mean = 358.48441
314           Photosensor reading: 2104807.0
315           Exposure time: 0.100000 secs
316           EX filter:  FITC
317           EM filter:  FITC
318           ND filter:  100%
319           Polychroic: Quad
320           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
321
322Image 21.
323           Time:       Thu May 19 13:57:50 2016
324           Time Point: 25.457 secs
325           Intensity:  Min = 113, Max = 1618, Mean = 356.54996
326           Photosensor reading: 2104807.0
327           Exposure time: 0.100000 secs
328           EX filter:  FITC
329           EM filter:  FITC
330           ND filter:  100%
331           Polychroic: Quad
332           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
333
334Image 22.
335           Time:       Thu May 19 13:57:50 2016
336           Time Point: 26.292 secs
337           Intensity:  Min = 114, Max = 1600, Mean = 354.76605
338           Photosensor reading: 2104807.0
339           Exposure time: 0.100000 secs
340           EX filter:  FITC
341           EM filter:  FITC
342           ND filter:  100%
343           Polychroic: Quad
344           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
345
346Image 23.
347           Time:       Thu May 19 13:57:52 2016
348           Time Point: 27.959 secs
349           Intensity:  Min = 114, Max = 1596, Mean = 353.38174
350           Photosensor reading: 2104807.0
351           Exposure time: 0.100000 secs
352           EX filter:  FITC
353           EM filter:  FITC
354           ND filter:  100%
355           Polychroic: Quad
356           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
357
358Image 24.
359           Time:       Thu May 19 13:57:54 2016
360           Time Point: 29.627 secs
361           Intensity:  Min = 114, Max = 1590, Mean = 351.85870
362           Photosensor reading: 2104807.0
363           Exposure time: 0.100000 secs
364           EX filter:  FITC
365           EM filter:  FITC
366           ND filter:  100%
367           Polychroic: Quad
368           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
369
370Image 25.
371           Time:       Thu May 19 13:57:55 2016
372           Time Point: 31.295 secs
373           Intensity:  Min = 114, Max = 1567, Mean = 350.34940
374           Photosensor reading: 2104807.0
375           Exposure time: 0.100000 secs
376           EX filter:  FITC
377           EM filter:  FITC
378           ND filter:  100%
379           Polychroic: Quad
380           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
381
382Image 26.
383           Time:       Thu May 19 13:57:57 2016
384           Time Point: 32.962 secs
385           Intensity:  Min = 113, Max = 1576, Mean = 348.91803
386           Photosensor reading: 2104807.0
387           Exposure time: 0.100000 secs
388           EX filter:  FITC
389           EM filter:  FITC
390           ND filter:  100%
391           Polychroic: Quad
392           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
393
394Image 27.
395           Time:       Thu May 19 13:57:59 2016
396           Time Point: 34.630 secs
397           Intensity:  Min = 111, Max = 1549, Mean = 347.35620
398           Photosensor reading: 2104807.0
399           Exposure time: 0.100000 secs
400           EX filter:  FITC
401           EM filter:  FITC
402           ND filter:  100%
403           Polychroic: Quad
404           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
405
406Image 28.
407           Time:       Thu May 19 13:58:00 2016
408           Time Point: 36.298 secs
409           Intensity:  Min = 111, Max = 1548, Mean = 345.82108
410           Photosensor reading: 2104807.0
411           Exposure time: 0.100000 secs
412           EX filter:  FITC
413           EM filter:  FITC
414           ND filter:  100%
415           Polychroic: Quad
416           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
417
418Image 29.
419           Time:       Thu May 19 13:58:02 2016
420           Time Point: 37.966 secs
421           Intensity:  Min = 114, Max = 1547, Mean = 344.59515
422           Photosensor reading: 2104807.0
423           Exposure time: 0.100000 secs
424           EX filter:  FITC
425           EM filter:  FITC
426           ND filter:  100%
427           Polychroic: Quad
428           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
429
430Image 30.
431           Time:       Thu May 19 13:58:04 2016
432           Time Point: 39.634 secs
433           Intensity:  Min = 111, Max = 1517, Mean = 343.17896
434           Photosensor reading: 2104807.0
435           Exposure time: 0.100000 secs
436           EX filter:  FITC
437           EM filter:  FITC
438           ND filter:  100%
439           Polychroic: Quad
440           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
441
442Image 31.
443           Time:       Thu May 19 13:58:05 2016
444           Time Point: 41.301 secs
445           Intensity:  Min = 113, Max = 1522, Mean = 341.84564
446           Photosensor reading: 2104807.0
447           Exposure time: 0.100000 secs
448           EX filter:  FITC
449           EM filter:  FITC
450           ND filter:  100%
451           Polychroic: Quad
452           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
453
454Image 32.
455           Time:       Thu May 19 13:58:07 2016
456           Time Point: 42.969 secs
457           Intensity:  Min = 113, Max = 1493, Mean = 340.29913
458           Photosensor reading: 2104807.0
459           Exposure time: 0.100000 secs
460           EX filter:  FITC
461           EM filter:  FITC
462           ND filter:  100%
463           Polychroic: Quad
464           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
465
466Image 33.
467           Time:       Thu May 19 13:58:09 2016
468           Time Point: 44.637 secs
469           Intensity:  Min = 113, Max = 1510, Mean = 338.68192
470           Photosensor reading: 2104807.0
471           Exposure time: 0.100000 secs
472           EX filter:  FITC
473           EM filter:  FITC
474           ND filter:  100%
475           Polychroic: Quad
476           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
477
478Image 34.
479           Time:       Thu May 19 13:58:10 2016
480           Time Point: 46.305 secs
481           Intensity:  Min = 110, Max = 1506, Mean = 337.43726
482           Photosensor reading: 2104807.0
483           Exposure time: 0.100000 secs
484           EX filter:  FITC
485           EM filter:  FITC
486           ND filter:  100%
487           Polychroic: Quad
488           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
489
490Image 35.
491           Time:       Thu May 19 13:58:12 2016
492           Time Point: 47.973 secs
493           Intensity:  Min = 113, Max = 1503, Mean = 335.88574
494           Photosensor reading: 2104807.0
495           Exposure time: 0.100000 secs
496           EX filter:  FITC
497           EM filter:  FITC
498           ND filter:  100%
499           Polychroic: Quad
500           Stage coordinates:   (-9229.920,-1717.587,+0.000)
501
502QLM Settings for PhotoKinetics Experiment:
503     Laser 406 nm, Power 20.00(%), 4.00(mW), Duration 0.1000
504     Beam Expander Position 0, Laser Spot Radius 0.00 um
505
506     Laser Event Locations (x,y):
507          45.62, 45.39 (spot)
508          43.55, 42.95 (spot)
509          41.49, 40.50 (spot)
510          39.43, 38.06 (spot)
511          47.36, 47.52 (spot)
512     PhotoKinetics Scan Time Adjustment:
513          First Acquisition Time:   1849.824
514          Time of PK Event:         1867.369
515          Adjustment:               17.545
516               Image 1 before: 0.000  after: -17.545
517               Image 2 before: 0.703  after: -16.842
518               Image 3 before: 1.407  after: -16.138
519               Image 4 before: 18.062  after: 0.517
520               Image 5 before: 18.265  after: 0.720
521               Image 6 before: 18.467  after: 0.922
522               Image 7 before: 18.670  after: 1.125
523               Image 8 before: 18.872  after: 1.327
524               Image 9 before: 19.074  after: 1.529
525               Image 10 before: 19.276  after: 1.731
526               Image 11 before: 19.610  after: 2.065
527               Image 12 before: 19.944  after: 2.399
528               Image 13 before: 20.278  after: 2.733
529               Image 14 before: 20.613  after: 3.068
530               Image 15 before: 20.948  after: 3.403
531               Image 16 before: 21.283  after: 3.738
532               Image 17 before: 22.118  after: 4.573
533               Image 18 before: 22.953  after: 5.408
534               Image 19 before: 23.788  after: 6.243
535               Image 20 before: 24.622  after: 7.077
536               Image 21 before: 25.457  after: 7.912
537               Image 22 before: 26.292  after: 8.747
538               Image 23 before: 27.959  after: 10.414
539               Image 24 before: 29.627  after: 12.082
540               Image 25 before: 31.295  after: 13.750
541               Image 26 before: 32.962  after: 15.417
542               Image 27 before: 34.630  after: 17.085
543               Image 28 before: 36.298  after: 18.753
544               Image 29 before: 37.966  after: 20.421
545               Image 30 before: 39.634  after: 22.089
546               Image 31 before: 41.301  after: 23.756
547               Image 32 before: 42.969  after: 25.424
548               Image 33 before: 44.637  after: 27.092
549               Image 34 before: 46.305  after: 28.760
550               Image 35 before: 47.973  after: 30.428
551Total number of images saved: 35

1.3.13-PRO © 2008-2011 Agilo Software all rights reserved (this page was served in: 0.44721 sec.)

© 2000-2014 University of Dundee & Open Microscopy Environment. Creative Commons Attribution 3.0 Unported License
OME source code is available under the GNU General public license or through commercial license from Glencoe Software

We're Hiring!